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碣石調幽蘭：孔子周遊列國，沒有一國肯重用他。在歸途中見到幽谷中盛開的蘭花，於是感慨地說：蘭花本是香花之王，如今卻和雜草叢生在一起，正像賢德的人生不逢時一樣，並彈琴作了幽蘭。幽蘭是至今僅存的一首用原始文字譜保留下來的琴曲。
獲麟：原譜出現於神奇秘譜。根據記譜法和樂曲結構，可以看出與後期琴曲有顯著的差別，可能是較古老的作品。魯哀公時，有人捕獲了一隻麟，但是使它受了傷。孔子去看了以後，感到很悲傷，認為這種祥瑞的動物是出其非時而見害。樂曲以羽調式為基礎，交替出現徵調式和宮調式。運用泛音與散音交織成曲調，在很多地方使用了雙音，包括：八度、五度、三度、二度、同度等。在形式上很有特點。
高山、流水：伯牙彈琴可以表現出他的「巍巍乎志在高山」或是「洋洋乎志在流水」。而他的好友鐘子期，完全能夠準確地領略到他的音樂表現。唐以後，發展為高山與流水兩個獨立的琴曲。其中流水一曲，在近代得到更多的發展，特別是天聞閣琴譜中所載川派張孔山的流水。由於它充分運用了「滾、拂」等指法，進一步表現了流水中奔騰澎湃的效果。
長清：晉代嵇康作長清、短清、長側、短側，總稱為嵇氏四弄，它們與蔡邕的蔡氏五弄合稱「九弄」。長清的內容是借雪的潔白無塵以自比。
梅花三弄：晉隋以來有此笛曲。後經唐代琴家顏師古改編為琴曲，曲譜初見於神奇秘譜。樂曲的名稱來由，源自前半部的泛音曲調在不同的徽位上作三次的重複，用來描繪梅花的清雅高潔。樂曲的後半部則用稍快的曲調再加上音色的變化，來表達梅花在寒風中迎風搖曳的堅毅不屈的形態。
陽關三疊：唐代詩人王維作送元二使安西，流傳甚廣，被入樂唱詠之餘更被譜為琴曲，是為陽關三疊。此曲初見於浙音釋自琴譜，旋律在稍加變化後重複三次，以表達一唱三歎、依依惜別的真摯感情。
醉漁唱晚：唐代詩人皮日休、陸龜蒙泛舟松江，聽漁人醉歌而作此曲。曲譜初見於西麓堂琴統。音樂利用切分結構、滑音指法和音型的重複來表現豪放不羈的醉態。其中有表現放聲高歌的音調和類似於搖櫓聲的音調。全曲素材精練，結構嚴謹。
漁歌、樵歌：南宋末年著名琴師毛敏仲最有影響的兩首作品。漁歌表現柳宗元「唉乃一聲山水綠」的詩意，曾名山水綠；樵歌原名歸樵。這兩個作品在名稱改變的同時，音樂本身也經浙派徐門不斷加工，精益求精。樂曲中運用主題貫穿和轉調等手法，顯示出作曲藝術的新水平。
陽春：陽春白雪被稱為曲高和寡的代表作品，後來被分成兩個不同的作品。神奇秘譜的解題中說它「取萬物知春，和風淡蕩之意」。
酒狂：曹魏末期，在司馬氏的恐怖統治下，名人學士很難保全自己。阮籍歎「道之不行，與時不合」，只好「托興於酒」，藉以掩飾自己。傳說此曲是他的作品。樂曲通過醉酒的神態，抒發了內心憤懣不安的情緒。
漁樵問答：存譜初見於杏莊太音續譜。樂曲中通過漁樵對話的方式，在清山綠水之間讚美自然風光。曲中有一些悠然自得的樂句重複或移位再現，形成了問答的對話效果。還有一些模擬搖船和砍樹的效果，造成了對漁樵生活的聯想。近代琴學初津中說它「曲意深長，神情灑脫，而山之巍巍，水之洋洋，斧伐之丁丁，櫓聲之唉乃，隱隱現於指下，至問答之段，另人有山林之想。」
瀟湘水云：作者郭楚望，南宋末年著名琴師。由於當時政治腐敗不堪，對異族的侵略無能為力，作者在瀟、湘水畔北望九嶷山北雲霧所遮蔽，有感於時勢，作此曲以表達他忠貞抑鬱的情緒。樂曲中運用按指蕩吟的手法，以及不同音色迭次呼應等手法所創造的水光雲影、煙霧繚繞的藝術境界，十分吸引人。
普安咒：又名釋談章。初見於三教同聲琴譜。根據琴譜旁的梵文字母的漢字譯音來看，像是幫助學習梵文發音的曲調。古代曾有普安禪師，也可能是此曲的作者。樂曲使用了較多的撮音，幫助音樂造成了古剎聞禪、莊嚴肅穆的氣氛。曲式上不同於一般琴曲，有些類似於絲竹曲中曲牌聯結的形式。
良宵引：初見於松弦館琴譜，為虞山派代表曲目。樂曲雖短小，卻有器樂化的特點。是一曲美好夜晚的讚歌。
平沙落雁：初見於古音正宗等琴譜中，近三百年來流傳極為廣泛，形成了多種多樣的變化。樂曲描寫在秋高氣爽之季，雁群在天空飛鳴，然後歇落沙灘的情景，借樂曲淡雅恬靜的意境引出與世無爭的思想。
鹿鳴：古琴曲。為詩經—小雅首篇，也是漢代僅存雅歌四篇之一。蔡邕琴賦、琴操均有此曲目。明代張廷玉將此曲收入理性元雅琴譜，直至清末仍有刊傳。
廣陵散：又名廣陵止息。現存琴譜最早見於神奇秘譜，該書編者說，此譜傳自隋宮，歷唐至宋，輾轉流傳於後。譜中分段小標題有「取韓」、「投劍」等目。近人因此認為它是源於琴操所載聶政刺韓王曲。現存曲譜共四十五段，其中頭尾幾部分似為後人所增益，而正聲前後三部分則很有可能保留著相和大曲的形式。
大胡笳：唐代的著名琴家董庭蘭、薛易簡都擅彈此曲。當時與小胡笳並稱胡笳兩本。初唐琴壇流行的祝家聲、沈家聲，就以這兩曲著稱。董庭蘭繼承了兩家的傳統，整理了傳譜。該曲現存於神奇秘譜中，共十八段。
小胡笳：唐代著名琴曲，與大胡笳並稱胡笳兩本。神奇秘譜將它編入太古神品。它的譜式更多地保留了早期琴曲的面貌，與廣陵散章法非常接近，對瞭解古代琴曲作品提供了難得的實例。
鷗鷺忘機：內容原來表現列子中一則寓言：漁翁出海時，鷗鷺常飛下來與之親近，後來他受人指使，存心捕捉它們，鷗鷺就對他疏遠了。清代的鷗鷺忘機則是一首動聽的抒情小品。表現了「海日朝暉，滄江夕照，群鳥眾和，翱翔自得。」
龍翔操：清代廣陵派琴曲。以蕉庵琴譜所刊最為流行。音樂恰如標題所示。以流暢的曲調表現了翔龍飛舞，穿雲入霧的情趣。
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